在亞美斯多利斯期間愛德華?艾爾利克（樸璐美 飾）和弟弟阿爾方斯（釘宮理恵 飾）遭遇了還有兩個(gè)月就可以刑滿釋放的越獄犯梅爾文（森川智之 飾）結(jié)果發(fā)現(xiàn)對(duì)方擁有不輸于艾爾利克兄弟的強(qiáng)大煉金術(shù)根據(jù)梅爾文在監(jiān)獄留下的蛛絲馬跡兄弟二人前往西方的大國古雷達(dá)調(diào)查在這里他們的火車遭到神秘黑蝙蝠的襲擊同時(shí)也遇到了梅爾文尋找的少女茱莉亞?克萊頓（坂本真綾 飾）一番混亂之后他們相繼來到位于地下的貧困之鎮(zhèn)米洛斯米洛斯是大國夾縫中的犧牲品而她的人民也決定利用圣星的利用重新復(fù)興祖國與民族…… 　　本片根據(jù)荒川弘的漫畫原著改編